ركزت هذه الدراسة على عدد من الأهداف الرئيسية وهي تتبع المصدر الميكروبي الاكثر تأثيرا على ملوثات البراز في مياه نهر دجلة ضمن مدينة بغداد باستخدام rep-PCR كأحد طرق تتبع المصدر الميكروبي الجزيئية.
كما تضمنت هذه الدراسة استخدام طريقة قيمة التناسب بين مؤشرات البراز القولونية ومؤشرات البراز العقدية بالإضافة الى تطبيق تقنية التنميط الجيني الوراثي (البصمة الوراثية) للتتابعات الجينية المنتشرة في الكروموسوم البكتيري حيث تم عزل بكتيريا الاشريكية القولونية من اربع مواقع من عينات مياه نهر دجلة اضافة الى خمسة وعشرين عينة براز تم جمعها من متطوعين بشريين ،ومن طيور حرة المعيشة مثل النوارس ، الحمام ، الغربان السوداء ومن الحيوانات الاليفة المنزلية مثل الدجاج والبط ، الكلاب والقطط وطيور الحب و البلابل ومن مزارع المواشي و الاماكن التي يتم فيها تربية المواشي و الطيور الداجنة بشكل غير رسمي في وسط المدينة مثل الابقار الاغنام والماعز