انشئت وحدة صندوق التعليم العالي في كلية التربية للبنات اولاً في تسعينيات القرن الماضي ،  وعند انشطار كلية العلوم للبنات عن كلية التربية للبنات في نهاية سنة 2002 استمرت الوحدة بعملها وتقديم خدماتها للكلية وطالباتها واساتذتها لغاية يومنا هذا ، وتدار الوحدة من قبل مجلس ادارة صندوق التعليم العالي المكون من عميد الكلية / رئيس المجلس و معاون العميد للشؤوون الادارية والمالية / عضوا ً ونائب رئيس وعضوية ثلاثة من رؤساء الاقسام العلمية وعضوا مالياً ومقرراً للمجلس ، وتعد الوحدة كيان مستقل مادياَ ومعنوياً ذات قرارات نهائية وتعتمد وحدة الصندوق على قانون 122 لسنة 1999 وتعديلاته في استحصال ايراداتها وتوزيعها ، للوحدة حساب مصرفي حكومي خاص بها ، وينضوي تحت جناح الوحدة حسابات الدراسات المسائية .